Archiv ausgepackt und User oder Rechte stimmen nicht mehr?

Zum Ändern aller Dateien (ohne Verzeichnisse):

find . -type f -exec chmod 644 {} +

Zum Ändern allerVerzeichnisse (ohne Dateien):

find . -type d -exec chmod 755 {} +

User ändern rekursiv (hier: User|Gruppe www-data für Verzeichnis htdocs):

chown -R www-data:www-data htdocs/*